有机肥料如饼肥、厩肥、油粕、人粪尿、骨粉、兽蹄片和羊角以及动植物残体等，营养元素齐全，肥效持久，且有改良土壤之教。

有机肥料使用前应充分发酵，以免烧伤花木。其中饼肥是盆栽花卉的重要肥料，常用作追肥，有液施与干施之分。①液施。饼肥末2千克，加水10千克，另加过磷酸钙0.1克，腐熟后成为原液，按花卉种类加水稀释后施用。其中需肥较多及生长健牡的花卉，原液加水10倍施用；花木及野生花卉，原液加水20～30倍施用；高山花卉、兰科植物，原液加水100—200倍施用。②干施。在饼肥中加四成水使之发酵，而后干燥，施用时埋入盆边的四周，经浇水使其慢慢分解不断供应养分。饼肥发酵干燥后，亦可碾碎混入培养土中作基肥。

人粪尿也是盆栽花卉常用肥料，大粪晒干，碾细过筛，制成粪干末与培养土混合作基肥，也可混入盆土表面或埋入盆边四周作追肥。人粪尿加水10倍，发酵腐熟后取其清液，作液肥使用。

无机肥料以化肥为主，一般作追肥，如硫酸铵、尿素、过磷酸钙、硫酸亚铁、硝酸钾等。这类肥料能迅速溶解于水，植物能够很快地吸收，但营养元素单纯，肥效不易持久。